Al voltant d'Empuries hi havia un poblament consistent en petites communitats rurals i edificacions religioses, a vagades bastides sobre restes que es poden remontar a època paleocristiana. Aquest es el cas de les petites esglesies de Santa Margarida i Santa Magdalena, que, juntament amb la capella de Sant Vicenç a les Corts, perduraren durant tota l'Edat Mitjana.